MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Krokinobacter sp. 4H-3-7-5 chromosome

Total Repeats: 65106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015496	TC	3	6	198	203	0 %	50 %	0 %	50 %	332290651
2	NC_015496	TTA	2	6	206	211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290651
3	NC_015496	AGA	2	6	327	332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290651
4	NC_015496	CTT	2	6	346	351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290651
5	NC_015496	AAT	2	6	427	432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290651
6	NC_015496	GGA	2	6	667	672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332290651
7	NC_015496	CAT	2	6	674	679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290651
8	NC_015496	ACT	2	6	687	692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290651
9	NC_015496	TGG	2	6	699	704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332290651
10	NC_015496	AC	3	6	721	726	50 %	0 %	0 %	50 %	332290651
11	NC_015496	CTG	2	6	791	796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290651
12	NC_015496	ACA	2	6	807	812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290651
13	NC_015496	AT	3	6	813	818	50 %	50 %	0 %	0 %	332290651
14	NC_015496	AGA	2	6	830	835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290651
15	NC_015496	GAT	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290651
16	NC_015496	TTC	2	6	934	939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290651
17	NC_015496	ACC	2	6	950	955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290651
18	NC_015496	CTT	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290651
19	NC_015496	TAT	2	6	1098	1103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290651
20	NC_015496	AGA	2	6	1140	1145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290651
21	NC_015496	ATA	2	6	1166	1171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290651
22	NC_015496	AG	3	6	1186	1191	50 %	0 %	50 %	0 %	332290651
23	NC_015496	TAT	2	6	1203	1208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290651
24	NC_015496	CTT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290651
25	NC_015496	AAGA	2	8	1237	1244	75 %	0 %	25 %	0 %	332290651
26	NC_015496	AAG	2	6	1264	1269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290651
27	NC_015496	TACA	2	8	1318	1325	50 %	25 %	0 %	25 %	332290651
28	NC_015496	GATG	2	8	1350	1357	25 %	25 %	50 %	0 %	332290651
29	NC_015496	CAAG	2	8	1399	1406	50 %	0 %	25 %	25 %	332290651
30	NC_015496	AGA	2	6	1560	1565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290651
31	NC_015496	CT	3	6	1579	1584	0 %	50 %	0 %	50 %	332290651
32	NC_015496	TAAC	2	8	1728	1735	50 %	25 %	0 %	25 %	332290652
33	NC_015496	AGA	2	6	1767	1772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290652
34	NC_015496	AAT	2	6	1786	1791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290652
35	NC_015496	ATA	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290652
36	NC_015496	AGT	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290652
37	NC_015496	CCA	2	6	1839	1844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290652
38	NC_015496	T	6	6	1873	1878	0 %	100 %	0 %	0 %	332290652
39	NC_015496	CT	3	6	1960	1965	0 %	50 %	0 %	50 %	332290653
40	NC_015496	CTG	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290653
41	NC_015496	T	6	6	2174	2179	0 %	100 %	0 %	0 %	332290653
42	NC_015496	CTT	2	6	2246	2251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290653
43	NC_015496	TCCAC	2	10	2282	2291	20 %	20 %	0 %	60 %	332290653
44	NC_015496	AC	3	6	2360	2365	50 %	0 %	0 %	50 %	332290653
45	NC_015496	CTT	2	6	2375	2380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290653
46	NC_015496	GAA	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290653
47	NC_015496	ATA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290653
48	NC_015496	TTA	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290653
49	NC_015496	ACT	2	6	2481	2486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290653
50	NC_015496	TCC	3	9	2532	2540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290653
51	NC_015496	TCT	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290653
52	NC_015496	ATT	2	6	2610	2615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290653
53	NC_015496	A	6	6	2623	2628	100 %	0 %	0 %	0 %	332290653
54	NC_015496	TCT	2	6	2679	2684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290653
55	NC_015496	CTC	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290653
56	NC_015496	CAT	2	6	2714	2719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290653
57	NC_015496	CTT	3	9	2786	2794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290653
58	NC_015496	GAC	2	6	2807	2812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290653
59	NC_015496	T	7	7	2824	2830	0 %	100 %	0 %	0 %	332290653
60	NC_015496	TAA	2	6	2859	2864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290653
61	NC_015496	CAC	2	6	2898	2903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290653
62	NC_015496	TGT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290653
63	NC_015496	GGT	2	6	2992	2997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332290653
64	NC_015496	ATCC	2	8	3007	3014	25 %	25 %	0 %	50 %	332290653
65	NC_015496	TTC	2	6	3015	3020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290653
66	NC_015496	CTA	2	6	3032	3037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290653
67	NC_015496	T	7	7	3040	3046	0 %	100 %	0 %	0 %	332290653
68	NC_015496	ATT	2	6	3141	3146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290653
69	NC_015496	CAT	2	6	3197	3202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290653
70	NC_015496	TCC	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290653
71	NC_015496	T	6	6	3328	3333	0 %	100 %	0 %	0 %	332290653
72	NC_015496	TCC	2	6	3340	3345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290653
73	NC_015496	TTC	2	6	3426	3431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
74	NC_015496	TTA	2	6	3440	3445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290654
75	NC_015496	TTC	2	6	3459	3464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
76	NC_015496	TG	3	6	3535	3540	0 %	50 %	50 %	0 %	332290654
77	NC_015496	TCT	2	6	3592	3597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
78	NC_015496	AAG	2	6	3604	3609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290654
79	NC_015496	CAT	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
80	NC_015496	CCA	2	6	3673	3678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290654
81	NC_015496	TTC	2	6	3698	3703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
82	NC_015496	CTC	2	6	3728	3733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290654
83	NC_015496	ACA	2	6	3772	3777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290654
84	NC_015496	CAG	2	6	3842	3847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290654
85	NC_015496	AAT	2	6	3873	3878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
86	NC_015496	TA	3	6	3954	3959	50 %	50 %	0 %	0 %	332290654
87	NC_015496	TGC	2	6	4008	4013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290654
88	NC_015496	AAT	2	6	4171	4176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
89	NC_015496	CCTT	2	8	4261	4268	0 %	50 %	0 %	50 %	332290654
90	NC_015496	GAA	2	6	4283	4288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290654
91	NC_015496	CAT	2	6	4533	4538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
92	NC_015496	CTC	2	6	4581	4586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290654
93	NC_015496	TCAT	2	8	4669	4676	25 %	50 %	0 %	25 %	332290654
94	NC_015496	TGC	2	6	4687	4692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290654
95	NC_015496	GCG	2	6	4745	4750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332290654
96	NC_015496	CAT	2	6	4766	4771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
97	NC_015496	GC	3	6	4863	4868	0 %	0 %	50 %	50 %	332290654
98	NC_015496	CT	3	6	4869	4874	0 %	50 %	0 %	50 %	332290654
99	NC_015496	ATAA	2	8	4893	4900	75 %	25 %	0 %	0 %	332290654
100	NC_015496	GGT	2	6	4939	4944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332290654
101	NC_015496	AATC	2	8	4950	4957	50 %	25 %	0 %	25 %	332290654
102	NC_015496	CCT	2	6	5023	5028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290654
103	NC_015496	TTTGA	2	10	5055	5064	20 %	60 %	20 %	0 %	332290654
104	NC_015496	GCA	2	6	5071	5076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290654
105	NC_015496	CTTG	2	8	5120	5127	0 %	50 %	25 %	25 %	332290654
106	NC_015496	TCC	2	6	5184	5189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290654
107	NC_015496	CTT	2	6	5249	5254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
108	NC_015496	CTT	2	6	5321	5326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
109	NC_015496	AAC	2	6	5359	5364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290654
110	NC_015496	GTT	2	6	5381	5386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290654
111	NC_015496	ATT	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290654
112	NC_015496	CAC	2	6	5519	5524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290654
113	NC_015496	GCA	2	6	5545	5550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290654
114	NC_015496	TTTC	2	8	5552	5559	0 %	75 %	0 %	25 %	332290654
115	NC_015496	AGC	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290654
116	NC_015496	CTTA	2	8	5583	5590	25 %	50 %	0 %	25 %	332290654
117	NC_015496	ACT	2	6	5659	5664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
118	NC_015496	T	6	6	5664	5669	0 %	100 %	0 %	0 %	332290654
119	NC_015496	AAT	2	6	5689	5694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
120	NC_015496	TCA	2	6	5738	5743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
121	NC_015496	CCT	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290654
122	NC_015496	TCT	2	6	5821	5826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
123	NC_015496	GAT	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290654
124	NC_015496	AT	3	6	5854	5859	50 %	50 %	0 %	0 %	332290654
125	NC_015496	TCGCGC	2	12	5867	5878	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	332290654
126	NC_015496	ATA	2	6	5888	5893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
127	NC_015496	AAT	2	6	5931	5936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
128	NC_015496	TCT	2	6	5954	5959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
129	NC_015496	GTT	2	6	5976	5981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290654
130	NC_015496	TCA	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
131	NC_015496	GCT	2	6	6074	6079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290654
132	NC_015496	CT	4	8	6131	6138	0 %	50 %	0 %	50 %	332290654
133	NC_015496	ACT	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
134	NC_015496	CTC	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290654
135	NC_015496	AAT	2	6	6361	6366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
136	NC_015496	GCA	2	6	6409	6414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290654
137	NC_015496	CAT	2	6	6422	6427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
138	NC_015496	ATG	2	6	6475	6480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290654
139	NC_015496	TCT	2	6	6490	6495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
140	NC_015496	TG	3	6	6496	6501	0 %	50 %	50 %	0 %	332290654
141	NC_015496	TCA	2	6	6595	6600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
142	NC_015496	CTA	2	6	6680	6685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
143	NC_015496	CTA	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
144	NC_015496	TA	3	6	6837	6842	50 %	50 %	0 %	0 %	332290654
145	NC_015496	CAT	3	9	6969	6977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
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153	NC_015496	TTG	2	6	7220	7225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290654
154	NC_015496	TAA	2	6	7285	7290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
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157	NC_015496	GT	3	6	7396	7401	0 %	50 %	50 %	0 %	332290654
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159	NC_015496	GT	3	6	7453	7458	0 %	50 %	50 %	0 %	332290654
160	NC_015496	TTG	2	6	7461	7466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290654
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163	NC_015496	TC	3	6	7582	7587	0 %	50 %	0 %	50 %	332290654
164	NC_015496	CTTC	2	8	7696	7703	0 %	50 %	0 %	50 %	332290654
165	NC_015496	AGCT	2	8	7724	7731	25 %	25 %	25 %	25 %	332290654
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169	NC_015496	ATT	2	6	8395	8400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290655
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252	NC_015496	CTT	2	6	12725	12730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290660
253	NC_015496	CATG	2	8	12744	12751	25 %	25 %	25 %	25 %	332290660
254	NC_015496	T	6	6	12755	12760	0 %	100 %	0 %	0 %	332290661
255	NC_015496	AT	3	6	12806	12811	50 %	50 %	0 %	0 %	332290661
256	NC_015496	CTTT	2	8	12886	12893	0 %	75 %	0 %	25 %	332290661
257	NC_015496	GAT	3	9	12898	12906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290661
258	NC_015496	TTC	2	6	13002	13007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290661
259	NC_015496	CAG	2	6	13027	13032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290661
260	NC_015496	TCCA	2	8	13069	13076	25 %	25 %	0 %	50 %	332290661
261	NC_015496	CAA	2	6	13162	13167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290661
262	NC_015496	ACT	2	6	13188	13193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290661
263	NC_015496	ACC	2	6	13226	13231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290661
264	NC_015496	CATAAA	2	12	13316	13327	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332290661
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395	NC_015496	CTT	2	6	20740	20745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290666
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